Z wykształcenia jest prawnikiem. Ukończyła studia podyplomowe z zarządzania zasobami ludzkimi oraz studia Executive MBA. Agnieszka Malinowska jest menadżerem z wieloletnim doświadczeniem w zarządzaniu spółkami prawa handlowego, w tym także spółkami skarbu państwa. Specjalizuje się w audytach, restrukturyzacji i reorganizacji spółek kapitałowych.
W latach 2011-2016 była prezesem zarządu Energa Operator Eksploatacja Płock sp. z o. o. Zarządzana przez nią spółka była wyróżniona w dwóch prestiżowych konkursach magazynu Forbes. Zwieńczeniem wieloletniego doświadczenia Agnieszki Malinowskiej w branży energetycznej i sukcesów zarządzanej spółki było przyznanie jej w 2013 roku indywidualnej nagrody: zajęła 3. miejsce w rankingu „100 Kobiet Biznesu Pulsu Biznesu” w kategorii firmy z przychodem powyżej 50 mln zł.
Od 2019 do 2024 r. była prezesem spółki samorządowej zajmującej się zarządzaniem nieruchomościami oraz składowaniem odpadów.
W swojej karierze zdobyła także doświadczenie, pełniąc funkcję w radach nadzorczych. Od kwietnia 2024 r. została członkinią Rady Nadzorczej w Polskim Holdingu Hotelowym, a od lipca 2024 r. do końca września pełni funkcję członka zarządu PHH oddelegowanego przez Radę Nadzorczą Spółki.
Grupa PHH liczy obecnie ponad 50 hoteli i obiektów z blisko 6 tysiącami pokoi. Grupa współpracuje – jako franczyzobiorca – z czołowymi światowymi sieciami hotelowymi, takimi jak Marriott International, Hilton Worldwide, Best Western Hotels&Resorts, InterContinental Hotels Group, Louvre Hotels Group i Accor.
